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TRF：分析 DNA 序列中串联重复序列 - 知乎 Tandem Repeats Finder (TRF) 是一个用于分析 DNA 序列中串联重复序列的程序。 串联重复序列是指 DNA 中两个或多个相邻的、近似重复的核苷酸模式。 TRF 可以帮助用户定位和展示这些重复序列。 用户只需提交一个 FASTA 格式 的序列文件，无需指定模式、模式大小或其他参数。 程序会生成两个输出文件：一个 重复表文件 和一个 对齐文件。 重复表文件包含每个重复序列的位置、大小、拷贝数和核苷酸内容等信息。 TRF安装 # 克隆 TRF 的 GitHub 仓库： # 执行编译 # 编译完成后可执行文件储存在path to build src trf 路径下 # 添加环境变量（此时位于build文件夹下） TRF用法 # 查看帮助信息
GitHub - Benson-Genomics-Lab TRF: Tandem Repeats Finder: a program to . . . TRF is free software: you can redistribute it and or modify it under the terms of the GNU Affero General Public License as published by the Free Software Foundation, either version 3 of the License, or (at your option) any later version
trf 4. 10安装与使用-生信工具42_tandem repeat finder-CSDN博客 Tandem Repeats Finder (TRF) 是一个程序，用于定位并显示 DNA 序列中的串联重复。 用户只需提交一个以 FASTA 格式编写的序列，无需指定重复模式、模式大小或其他参数。 程序输出两个文件：一个重复表格文件和一个比对文件。 重复表格文件可以在 网页浏览器 中查看，包含每个重复的相关信息，包括其位置、大小、拷贝数量和核苷酸组成。 点击表格条目中的位置索引，可以打开另一个浏览器页面，显示重复序列与共识模式的比对结果。 程序运行速度非常快，可在几秒钟内分析约 0 5Mb 的序列。 提交的序列长度可以是任意的，程序可以检测模式大小范围在 1 到 2000 个碱基之间的重复。 编译指南 编译 TRF 需要： C 编译器（如 gcc 、 clang），并安装标准库。
TRF（tandem repeats finder ）安装与使用（一） - 简书 官网（https: tandem bu edu trf trf download html）下载Windows command line 64-bit，无需安装与解压，直接使用。 序言：七十年代末，一起剥皮案震惊了整个滨河市，随后出现的几起案子，更是在滨河造成了极大的恐慌，老刑警刘岩，带你破解 序言：滨河连续发生了三起死亡事件，死亡现场离奇诡异，居然都是意外死亡，警方通过查阅死者的电脑和手机，发现死者居然都 文 潘晓璐 我一进店门，熙熙楼的掌柜王于贵愁眉苦脸地迎上来，“玉大人，你说我怎么就摊上这事。 ” “怎么了？ ”我有些 文 不坏的土叔 我叫张陵，是天一观的道长。 经常有香客问我，道长，这世上最难降的妖魔是什么？ 我笑而不 港岛之恋（遗憾婚礼）
Tandem Repeats Finder Definitions and help information for TRF An explanation of how the TRF algorithm works A repository of downloadable TRF executables, precompiled for various platforms A link to the TRF Github repository for the open source version of TRF
TRF：重复序列预测软件 - 知乎 网址： Tandem Repeats Finder1 下载安装网址： https: github com Benson-Genomics-Lab TRFgit clone https: github com Benson-Genomics-Lab TRF cd TRF configure make make install src trf2 使用序列为…
【亲测免费】 Tandem Repeats Finder (TRF) 使用教程 Tandem Repeats Finder (TRF) 是一个用于分析 DNA 序列中串联重复序列的程序。 串联重复序列是指 DNA 中两个或多个相邻的、近似重复的核苷酸模式。 TRF 可以帮助用户定位和展示这些重复序列。 用户只需提交一个 FASTA 格式的序列文件，无需指定模式、模式大小或其他参数。 程序会生成两个输出文件：一个重复表文件和一个对齐文件。 重复表文件包含每个重复序列的位置、大小、拷贝数和核苷酸内容等信息。 2 项目快速启动 首先， 克隆 TRF 的 GitHub 仓库： 在终端中执行以下命令来编译 TRF： 编译完成后，可以使用以下命令来运行 TRF： 其中 yourfile fa 是你的 FASTA 格式输入文件。 3 应用案例和最佳实践