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CLEANIT GREENIT COMPOSTING
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CLEANIT GREENIT COMPOSTING
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20450 113 Ave,EDMONTON,AB,Canada
ZIP Code: Postal Code:
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7804510921
Fax Number:
7804528284
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USA SIC Code(Standard Industrial Classification Code):
495302
USA SIC Description:
Garbage Collection
Number of Employees:
5 to 9
Sales Amount:
$1 to 2.5 million
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Very Good
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Company News:
三种方式下载GEO芯片注释文件GPL - 腾讯云 生信入门群学员在芯片数据实战分析中遇到GEO数据库下载GPL芯片注释文件难题,本文介绍了三种解决方法:使用R包GEOquery和AnnoProbe,以及了解GEO官网网址构成借用其他下载工具。
GPL对应的Bioconductor注释包(最全) - CSDN博客 本文提供了一个全面的列表,展示了不同GPL平台号所对应的Bioconductor注释包,涵盖了从GPL32到GPL17897的各种生物芯片平台,包括Affymetrix、Agilent等品牌的产品。
第一个万能芯片探针ID注释平台R包 GPL32 NCBI现有的GPL已经过万了,但是bioconductor的芯片注释包不到一千,虽然bioconductor可以解决我们大部分的需要,比如affymetrix的95,133系列,深圳1 0st系列,HTA2 0系列,但是如果碰到比较生僻
查找GSE及对应GPL平台,注释包信息后还能画个热图 - 简书 查看过程中我发现这探针名(行名)不是我需要的基因名呀,应该是需要注释包来看探针名和基因名的对应关系 2 注释包(找到探针名和基因名的注释包-筛选我需要的基因对应的表达矩阵) 问题来了,我怎么知道这个表达矩阵所需的是 哪个测序平台? 用的 哪个注释包 做的注释? 【咋搜索的? 在哪里? 联网-打开浏览器-bing-输入GPL3921-第一条就是 GEO Accession viewer -打开就看见下图】 3 回到Rstudio中,下载注释包,读取探针名和基因名的对应关系表 4 读区要选择的基因名,过滤表达矩阵,画图 序言:七十年代末,一起剥皮案震惊了整个滨河市,随后出现的几起案子,更是在滨河造成了极大的恐慌,老刑警刘岩,带你破解
GPL对应的Bioconductor注释包(最全)_百度文库 GPL对应的Bioconductor注释包(最全)-GPL1322drosophila2[Drosophila_2] Affymetrix Drosophila Genome 2 0 ArrayGPL1352u133x3p[U133_X3P] Affymetrix HumaBaidu Nhomakorabea X3P 首页 文档 视频 音频 文集
一键获取GPL注释文件 - 腾讯云 GEO 官网中 GPL 的注释文件大概有三种表现形式,一是 soft 文件,二是由 soft 文件进行提取整理的 annot 文件,三是直接抽取 soft 文件形成的的 table 文件。实际使用的情况下, soft 文件由于体积过大不适合使用,如 GPL570 的 soft 文件足足有64G。
gpl16699平台的探针注释到基因名 - 知乎 现在我完成作业就遇到了gpl16699平台,它并没有bioconductor的包,所以需要下载gpl平台的soft文件,进行注释,官网 https: www ncbi nlm nih gov geo qu ery acc cgi?acc=GPL16699 可以看到信息如下:
GPL对应的Bioconductor注释包 - 简书 GPL对应的Bioconductor注释包 gpl bioc_package title GPL32 mgu74a [MG_U74A] Affymetrix Murine Genome U74A Array GPL33 mgu74b [MG_U74B] Affymetrix Murine Genome U74B Array
GPL对应的Bioconductor注释包(最全) - 360doc 使用homer进行peak注释 其中GENOMES部分对应的就是内置支持的物种,部分内容展示如下GENOMESv5 10 hg19 v6 0 human genome and annotation for UCSC hg19+ mm10
基于R语言的基因表达芯片注释流程-期刊-万方数据知识服务平台 基于R语言,将R程序包Rsubread、Rsamtools、refGenome和GenomicRanges整合为一个完整的流程,实现了基因表达芯片探针序列的自主注释 以应用范围最广的GPL570,GPL10558和曾使用的GPL21163芯片平台为测试数据进行重注释,并将GPL570的新注释与现存