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- 全基因组重测序和gwas区别? - 知乎
物种已经做过基因组测序的，再针对该物种的个体进行基因组测序就是重测序。 GWAS 是一种 群体基因组学 分析方法，群体越大结果越趋于准确，简单举个例子，100个肥胖的人，100个体型正常的人，基因组测序后分析，有些位点在肥胖人群中出现的概率显著的高于正常人群的概率，那么就可以说这些
- Large Neuropathology GWAS Finds Four New Dementia Genes
Neuropathology GWAS found four new genes linked to dementia endophenotypes Three associated with cerebrovascular disease, including a new locus near APOE The study also tied 19 known AD genes to specific pathologies
- 在gwas研究中如何寻找最显著的SNP值，然后再根据这个SNP位点筛选候选基因呢？ - 知乎
最显著的SNP指的是P值最小的点，在GWAS研究中一般认为P<5*10-8的点是有显著关联的。 比较早的GWAS研究是直接把这些P<5*10-8拿出来作为易感位点，后来会进一步用conditional 分析去寻找locus上的second signal，或者用stepwise 回归寻找可靠的causal SNP set（也叫做fine-mapping，精细定位）。 但是这些分析一般需要用
- Massive GWAS Meta-Analysis Digs Up Trove of Alzheimer’s Genes
A massive GWAS meta-analysis netted 42 new risk loci for AD Candidate genes in these loci fell into familiar pathways such as immunity and APP metabolism A polygenic risk score based on all known AD variants predicted progression to dementia with high accuracy
- GWAS与WGS的区别？ - 知乎
CNV 与 GWAS 中的关联：在 GWAS 数据中，总共报告了大约 16,000 个显著的 CNV-性状关联，相比之下，SNP 的主效应关联则超过 5 亿个。 重复性 CNV 的存在：重复性 CNV 比重复性 SNP 更常见，且占据了基因组中碱基对差异的更大比例。
- GWAS系列 - 知乎
GWAS前沿文献分享（一）| LT-FH：整合病例对照信息和疾病家族史的易感性阈值模型可进一步提高关联分析的功效 2020年5月，Nature Genetics杂志发表了题为“Liability threshold modeling of case–control status and family history of disease increases association power“的研究论文 [1]。
- GWAS和QTL有什么区别 最后都可以找到基因 他们是什么关系? - 知乎
虽然有点答非所问，还是给自己打个广告。前些日子好多小伙伴私信我，问我 GWAS 拿到一批数据，该如何处理，如何常规分析，如何找到可以挖掘的兴趣点，有哪些方面需要特别注意。所以我1️⃣一个实例录制了四五个视频，这里虽然没有说到 QTL 定位，但是关于GWAS，我七八年的经验大多数都在
- Largest Alzheimer GWAS in African Americans Finds New Variants
AD GWAS in African Americans included 8,000 participants Of 11 novel risk loci identified, four were common, seven rare Immunity, trafficking, lipid processing, and kidney development implicated in disease risk
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