- 基因、染色体、位点、SNP 位点,都是什么,它们之间有什么关系? - 知乎
基因、染色体、位点、SNP 位点,都是什么,它们之间有什么关系? 看到23 me,感觉很好奇,于是搜索了很多文章,想知道个人基因检测是怎么玩儿的。
- 想请教一下基因组SNP分析基本方法和流程是? - 知乎
SNP下游分析 | 利用VCF文件进行构建系统进化树 在之前的一篇推文中,我们学会了如何使用GATK软件对测序数据(基因组测序和转录组测序均可)进行变异分析(SNP、InDel),同时提取出可靠的变异位点。
- 能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀,如何理解呢? - 知乎
分子生物学 基因组学 能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀,如何理解呢? 因为看到这样一句话 [图片] 小白一枚,想请教Gene, allele, SNP三个的关系是什么呀,谢谢各位显示全部 关注者 34 被浏览
- SNP单核苷酸多态性跟点突变有什么区别? - 知乎
SNP是单碱基多态性,是一个群体概念,这个差异占群体的1%以上。 若 germline mutation频率<1%,我们认为是一个点突变。 SNP是各种生物都有的,通过同源基因比对得到的,一般不会发生变化,而点突变只对单一基因而言,所以从数量上SNP比点突变多得多。
- 在gwas研究中如何寻找最显著的SNP值,然后再根据这个SNP位点筛选候选基因呢? - 知乎
最显著的SNP指的是P值最小的点,在GWAS研究中一般认为P<5*10-8的点是有显著关联的。 比较早的GWAS研究是直接把这些P<5*10-8拿出来作为易感位点,后来会进一步用conditional 分析去寻找locus上的second signal,或者用stepwise 回归寻找可靠的causal SNP set(也叫做fine-mapping,精细定位)。 但是这些分析一般需要用
- 遗传学中什么是SNP什么是单倍型,他们俩有什么关系? - 知乎
SNP :是指基因组上由 单个核苷酸 的变异所引起的DNA序列 多态性。 如图: 单倍型:单倍型 (haplotype):位于一条染色体上某一区域的一组相关联的多个SNP等位位点被称作单倍型。 单倍型表示以基因*数字或数字字母组合表示,如 CYP2C9 *1, CYP2C9 *,如图:
- 如何通过snp位点找到候选基因? - 知乎
一般而言,SNP定位到目标基因,需要到的文件有SNP坐标信息(例如 vcf),基因功能注释信息(一般参考基因组的就行,既基因所对应的kegg或者go注释与编号),基因组注释信息(包含基因在染色体上的位置坐标,一般为 gff, gtf或者 gff3)。
- 能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀,如何理解呢?
能否通俗地讲一讲Gene, allele, SNP的关系呀,如何理解呢? 因为看到这样一句话 [图片] 小白一枚,想请教Gene, allele, SNP三个的关系是什么呀,谢谢各位 显示全部 关注者 34
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