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  • pdb文件如何打开? - 知乎
    在对PDB( pdb)文件进行操作时,有时仅需要保留蛋白链、核酸链、配体、或者水。 除了直接在文本文档格式下或者coot中对PDB文件中其他信息进行删除,还可以通过命令行的形式来提取,这种方法简便且不改变原PDB文件,避免出现误操作的情况。
  • 如何获得一个蛋白质的PDB编号? - 知乎
    问题不清楚:我理解你的问题是 1)我想知道一个 蛋白质 的 空间结构,想查查pdb,但是不知道编号。 这个好办,不需要知道 pdb编号。直接查蛋白质的名字,其他通用的ID就行了。一个蛋白质,视重要程度和实验难度,可能有从几个到上千又或者根本没有结构信息,所以蛋白质和pdb是一对多的关系
  • 请问已知蓝色绿色两个蛋白的pdb文件,怎么用pymol画出这样的图形? - 知乎
    请问已知蓝色绿色两个蛋白的pdb文件,怎么用pymol画出这样的图形? [图片] 图片的蓝色和绿色是两个蛋白,pdb文件可以下载到。 用pymol怎么画出这样的图形呢? 显示全部 关注者 2 被浏览
  • pymol如何保存成pdb格式? - 知乎
    pdb格式 图片取自:pdbintro 其次,我们需要知道Pymol中显示颜色的方式。Pymol有各种显示颜色的方案,我们这次会利用其能够根据b-factor上色的功能。 Pymol操作为:color选项 >> spectrum >> b-factors 我们第一步要生成一个9x9x9的格子。
  • pdb是什么文件格式? - 知乎
    在最基本的层面上, PDB 文件是原子和笛卡尔 (XYZ) 坐标的列表。相同的格式可用于表示任何物理对象。包含其他信息以提供有关原子的更多详细信息,以及将原子构建成氨基酸、将氨基酸(残基)构建成蛋白质以及将蛋白质构建成大分子。跳过第一列,第二列是顺序原子数。接下来,是原子符号
  • 使用PyMOL:当界面中有多个蛋白质分子时,如何移动其中的单独一个? - 知乎
    5 恢复原位或重置视图: - 如果你想要恢复分子到原来的位置,可以重新加载原始的PDB文件,或者使用`zoom`命令重置视图回到初始状态: ``` zoom all ``` 另外,你也可以使用`transform`命令来精确地移动分子,这允许你指定平移和旋转的具体参数。
  • 有没有生物大佬教教我PDB是什么啊?在线等,挺急的!!谢谢辽? - 知乎
    PDB门口的显示屏,摄于2019年 从左上角的世界地图可以看出,网站的访客遍布全世界。右侧罗列了访问最多的十个的美国城市(第一名是 纽约)和访问最多的十个非美国城市(第一名是佛山)。 下方的EMD-9987,则是该网站最近发布的结构。
  • 蓝屏报错ntkrnlmp. exe怎么解决? - 知乎
    分析结束后,在信息中查找“PROCESS_NAME”、“MODULE_NAME” 、 “IMAGE_NAME”和”FAILURE BUCKET_ID“,查看具体错误原因后进行针对性修复。 常见的修复方案有以下几种: 方案一:通过官方渠道更新或者重新安装电脑所有主要硬件 (包括 BIOS、独立和核心显卡、有线和无线网卡、声卡、SATA AHCI等) 的驱动程序




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