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- interproscan的安装与使用 - 简书
interproscan interproscan 是个基因注释工具,可以一次运行实现多个数据库的注释。 用户既可以提交蛋白序列也可以提交核酸序列,还可以对输出格式进行设置。 具体支持的数据库有: CDD COILS Gene3D HAMAP MOBIDB PANTHER Pfam PIRSF PRINTS PROSITE (Profiles and Patterns) SFLD
- interproscan 鉴定蛋白质结构域保守位点,并进行家族分类 - 知乎
Copyright © EMBL European Bioinformatics Institute, Hinxton, Cambridge, UK (http: www ebi ac uk) The InterProScan software itself is provided under the Apache License, Version 2 0 (http: www apache org licenses LICENSE-2 0 html)
- InterProScan本地化安装、配置、使用(含批量操作)-CSDN博客
InterProScan是一个基因注释工具,支持多种数据库和序列类型。 本地化安装的优点包括更快的注释速度和对DNA序列的注释,但安装复杂、需定期更新数据库和消耗大量计算资源。
- 研究生期间做基因家族分析,几乎天天用这个软件-腾讯云开发者社区-腾讯云
InterProScan是蛋白质功能预测工具,整合多数据库,全面注释蛋白质序列。 支持多输入输出,广泛应用于蛋白质功能注释。 Galaxy平台集成InterProScan,提供一站式服务,简化安装配置,提升效率。
- Installing InterProScan — interproscan-docs documentation
InterProScan uses the InterPro Match Lookup Service (MLS) to retrieve pre-calculated matches, thus reducing the total runtime By default, InterProScan is configured to use the web service hosted at the EBI, therefore, your servers will need to have external access to http: www ebi ac uk to use it
- InterProScan-蛋白质预测 - 组学大讲堂问答社区
InterProScan-蛋白质预测 InterProScan是InterPro数据库提供给用户的一个软件包,通过集成数据库鉴定蛋白质功能、所属的家族及其包含的结构域和位点
- InterProScan - InterPro - EMBL-EBI
This form enables you to submit sequences to the InterProScan web service for scanning against the InterPro protein signature databases Please note that you can submit up to 100 sequences at a time
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