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怎么截断蛋白结构域? - 知乎
1、查找蛋白质的结构域可以通过Pfam、InterPro、SMART等数据库进行。 2、截断结构域可以通过PCR定点突变或基因合成等方法来进行。
请问做基因家族鉴定，blast比对之后如何进一步筛选？如何 . . .
注：这些分析在之前写的基因家族鉴定分析以及单个基因分析流程的文章中都有。基于Pfam中hmm结构的基因家族分析基因家族分析的进一步筛选与鉴定单个基因的生信分析流程基因结构与进化分析： MEME 分析保守基序，TBtools 可视化基因结构（外显子-内含子分布）。基于 MEGA 构建多物种（拟南芥
如何预测蛋白质结构、结构域及其相互作用蛋白？ - 知乎
对于未知结构蛋白或者预测难度较高的蛋白预测模型可以考虑尝试I-TASSER, zhanglab ccmb med umich edu 这个预测软件在近5年的结构预测比赛中，都是排名第一或第二的。我印象里I-TASSER在结果里包含了预测蛋白结构域和互作蛋白。
请问用Tbtools做结构域可视化分析时总是出现如下报错，不 . . .
请问用Tbtools做结构域可视化分析时总是出现如下报错，不知道是啥原因? [图片] 显示全部关注者 2
用SMART预测蛋白质结构域怎么是这个结果? - 知乎
使用SMART（Simple Modular Architecture Research Tool）进行蛋白质结构域预测，可以得到该蛋白质序列中可能存在的结构域信息，如所包含的功能模块、结构域序列位置和相应的注释等。这些信息有助于了解蛋白质的功能和结构，并可用于预测蛋白质相互作用和进化研究等领域。
r2r3myb结构域如何确定？ - 知乎
综合分析：确定R2和R3结构域的存在，需要综合考虑序列比对、保守结构域搜索和结构预测等多种证据。实验验证：为了进一步验证预测结果，可以进行实验验证，如定点突变、蛋白质相互作用分析等。
如何分析目标基因的氨基酸序列保守性和功能域？ - 知乎
分析预测结果：结合序列比对结果，确定目标基因中保守的功能域，并推测其可能的功能。 5 结构预测同源建模：如果目标基因的氨基酸序列与已知结构的蛋白质具有一定的相似性，可以使用同源建模软件（如SWISS-MODEL）预测其三维结构。
在做生信分析的保守基序分析时，已经做出来motif图，请问 . . .
结构域的序列你应该是已知的了，用motif的序列去比对结构域的序列就好了。既然是保守基序，大概率完全匹配或者1-2个mismatch，用python和R直接比对就好了。