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什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC思路: 通过Tn5转座酶(在染色质开放区域各种切割,形成复合物后插入到靶序列)来富集开放染色质的DNA序列,PCR扩增后NGS测序。 官方一点的话:DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象,由DNA转座酶来实现。
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
ATAC思路: 通过Tn5转座酶(在染色质开放区域各种切割,形成复合物后插入到靶序列)来富集开放染色质的DNA序列,PCR扩增后NGS测序。 官方一点的话:DNA转座,是一种把DNA序列从染色体的一个区域搬运到另外一个区域的现象,由DNA转座酶来实现。
什么是「ATAC-seq 技术」?现在用于哪些生物学研究? - 知乎
康测科技为本研究提供ATAC-seq和LncRNA-seq技术服务。 通过对20对前列腺癌和邻近正常前列腺组织进行ATAC-seq来分析前列腺肿瘤发生中的染色质可及性变化。
atac-seq和chip-seq的区别? - 知乎
ATAC-seq(Assay for Transposase – Accessible Chromatin with highthroughput sequencing),通过Tn5转座酶将测序接头插入染色质的开放区域,然后通过测序数据来推断染色质区域的可接触性,并计算转录因子结合位点和核小体的区域位置。
ATAC 或 chip-seq中peak 图,下方基因位置中方框、箭头代表什么意思? - 知乎
ATAC-Seq是一种新型的研究开放染色质的技术,利用Tn5转座酶进入并切割裸露的DNA,并同时连接上特异性的测序接头。 因为切割和加接头一步完成,因此该技术可大大降低所需细胞起始量。
分析单细胞atac数据比较全面的工具是只有archar和signac麽? - 知乎
引言 在本教学指南中,我们将探讨由10x Genomics公司提供的人类外周血单核细胞(PBMCs)的单细胞ATAC-seq数据集。 加载包 首先加载 Signac、Seurat 和我们将用于分析人类数据的其他一些包。
利用HiC数据和ATACseq数据怎样鉴定增强子?或者有相关的文献嘛? - 知乎
ATACseq - 使用转座酶并提供一种同时从单个样本的转录因子结合位点和核小体位置提取信号的方法。 1 数据类型 上面这意味着我们的数据中可能包含多种信号类型。 我们将从无核小体区域和转录因子(我们的较短片段)周围获得信号。 我们的一部分信号将来自开放染色质(较长片段)中的核小体
ATAC-seq质量分析该如何分析,给出的fragment图与标准图相比明显有差异但是具体的原因不知? - 知乎
ATAC-seq技术的发展得益于Tn5转座酶的研究,Tn5转座酶的应用,大大简化了开放染色质研究的时间,从最初2-3天的实验周期,缩短到2-3小时【5】。
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